Perjalanannya ke bidang pendidikan bermula pada tahun 1969 di sebuah sekolah rendah di Desa Pisang, Kabupaten Penengah, Lampung Selatan. Dia menamatkan tahap sekolah rendahnya pada tahun 1975. Setelah itu, Zulkifli Hasan dibawa oleh ayahnya ke Kota Tanjung Karang, ibu kota Bandar Lampung, untuk melanjutkan pelajaran ke peringkat Sekolah Menengah Pertama di PGAN (Pendidikan Guru Agama Awam) Tanjung Karang. Setelah 4 tahun menerima pendidikan agama setaraf dengan sekolah menengah pertama, Zulkifli Hasan secara diam-diam meninggalkan kampung halamannya di Lampung dan berhijrah ke Jakarta untuk mengikuti SMA Negeri 53 Jakarta. Setelah menamatkan sekolah menengah pada tahun 1982, dia kemudian melanjutkan pendidikannya di Fakulti Ekonomi, Universitas Krisnadwipayana (Unkris), Jakarta dan membayar tuisyennya secara bebas. Setelah menamatkan pengajian di peringkat S-1 pada tahun 1996, dia kemudian bekerja di beberapa institusi. Beberapa tahun kemudian, dia melanjutkan pendidikan di Masters of Management di PPM Management College, Jakarta dan lulus pada tahun 2003